مطالعه توالی، خاصیت آنتی ژنی و ساختار سه بعدی پروتئین های غیراختصاصی ناقل لیپید۲ در برنج ایرانی: ارزیابی بیوانفورماتیکی

نویسندگان

فاطمه زهرا درویشی

دانش آموخته کارشناسی ارشد دانشگاه اصفهان مهران میراولیائی

عضو هیئت علمی/ دانشگاه اصفهان رحمان امام زاده

هیات علمی مجید متولی باشی

هیات علمی دانشگاه اصفهان محبوبه نظری

چکیده

پروتئین های غیراختصاصی ناقل لیپید 2(nsltp2) یکی از اعضای خانواده پرولامین ها هستند که به دلیل ساختار ویژه خود توانایی انتقال ترکیبات لیپوفیل مختلفی را دارند. با وجود مزیت های نسبی پروتئین ltp2 در انتقال دارو، خاصیت آلرژنی این پروتئین ها نیز گزارش شده است. هدف مطالعه حاضر بررسی توالی و ساختار پروتئین nsltp2 برنج ایرانی و نیز بهبود برخی از ویژگی های آن برای استفاده در سیستم های تحویل دارو، توسط ابزارهای بیوانفورماتیک است. مقایسه توالی پروتئین های nsltp2 انواع برنج، حداقل 51% شباهت بین گونه های مختلف را نشان می دهد. بر اساس ارزیابی های فیلوژنی مشخص شد که بیشترین شباهت بین توالی ژن این پروتئین با گونه ژاپنی (accession no. np 0011048723.1) وجود دارد. موتیف ها و جایگاه های مختلف nsltp2 برنج ایرانی با کمک آنالیز توالی به دست آمد. همچنین مطالعات بیوانفورماتیکی نشان دهنده 4 جایگاه با خاصیت شبه آنتی ژنی است که 3 عدد آن بعد از تغییرات پس از ترجمه باقی می ماند و حضور آنها می تواند خاصیت آلرژنی این پروتئین ها را توجیه کند. همچنین، بررسی توالی دو گونه ژاپنی و ایرانی موید این است که اسیدهای آمینه شرکت کننده در جایگاه فعال، به-طورکامل حفاظت شده است. به منظور مطالعه تاثیر حذف توالی های آلرژن بر تمایل به لیگاندهای هیدروفوب، از روش مدل سازی در راستای تعیین ساختار، استفاده گردید. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که در صورت اعمال تغییراتی در توالی و حذف بخش های آلرژن nsltp2، احتمالا می توان بازده پروتئین را در سیستم های تحویل دارو افزایش داد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مطالعه توالی، خاصیت آنتی‌ژنی و ساختار سه بعدی پروتئین های غیراختصاصی ناقل لیپید2 در برنج ایرانی: ارزیابی بیوانفورماتیکی

پروتئین‌های غیراختصاصی ناقل لیپید 2(nsLTP2) یکی از اعضای خانواده پرولامین‌ها هستند که به‌ دلیل ساختار ویژه خود توانایی انتقال ترکیبات لیپوفیل مختلفی را دارند. با وجود مزیت‌های نسبی پروتئین LTP2 در انتقال دارو، خاصیت آلرژنی این پروتئین‌ها نیز گزارش شده است. هدف مطالعه حاضر بررسی توالی و ساختار پروتئین nsLTP2 برنج ایرانی و نیز بهبود برخی از ویژگی های آن برای استفاده در سیستم‌های تحویل دارو، توسط...

متن کامل

مطالعه توالی، خاصیت آنتی ژنی و ساختار سه بعدی پروتئین های غیراختصاصی ناقل لیپید2 در برنج ایرانی: ارزیابی بیوانفورماتیکی

پروتئین های غیراختصاصی ناقل لیپید 2(nsltp2) یکی از اعضای خانواده پرولامین ها هستند که به دلیل ساختار ویژه خود توانایی انتقال ترکیبات لیپوفیل مختلفی را دارند. با وجود مزیت های نسبی پروتئین ltp2 در انتقال دارو، خاصیت آلرژنی این پروتئین ها نیز گزارش شده است. هدف مطالعه حاضر بررسی توالی و ساختار پروتئین nsltp2 برنج ایرانی و نیز بهبود برخی از ویژگی های آن برای استفاده در سیستم های تحویل دارو، توسط ا...

متن کامل

کلونینگ و توالی یابی ژن p- انسولین جدا شده از گیاه دارویی Momordica charantia و تحلیل بیوانفورماتیکی ساختار سه بعدی پروتئین

چکیده سابقه و هدف: دیابت بیماری است که بدن توانایی کنترل قند خون را از دست می دهد. داروهای شیمیایی تجویز شده به منظور درمان قند خون دارای اثرات جانبی نامطلوب متعددی هستند. در این زمینه داروهای گیاهی جایگزین بسیار مناسبی میباشند چون اثرات جانبی بسیار کم تری دارند. گیاه کارلا با نام علمی Momordica charantia از خانواده Cucurbitaceae می باشد. بذرهای کارلا دارای پلی پپتیدی به نام p-انسو...

متن کامل

پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی ALS1 و HWP1 در جدایه های واژینالی کاندیدا آلبیکنس با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی

زمینه و اهداف: توانایی تشخیص مناطق آنتی ژنی در پروتئین ها از جمله عوامل مهم برای درمان می باشد. هدف از این مطالعه پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی ALS1 (Agglutinin Like Sequence) و HWP1 (Hyphal Wall Protein Sequences) در جدایه های کاندیدا آلبیکنس عامل عفونت واژینالی با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی می باشد. مواد و روش کار: در این بررسی 7 جدایه از زنان مبتلا به عفونت واژینال که طی سال ...

متن کامل

طراحی، ساخت، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنیRTB-ipaD: راهی نوین در جهت تولید واکسن شیگلوزیس

زمینه و هدف: شیگلا شایع ترین عامل اسهال می‌باشد. آنتی‌ژن پلاسمیدی IpaD برای تهاجم باکتری به درون سلول میزبان ضروری می‌باشد. یکی از چالش‌ها در باره واکسن مخاطی علیه شیگلا بر پایه پروتئین IpaD قدرت پایین آن می‌باشد. به نظر می‌رسد که با متصل کردن IpaD به یک ناقل و ادجوانت مناسب همچون زیر واحد B سم ریسین، می‌توان پروتئین IpaD را بسیار ایمنوژنیک نمود. این مطالعه به منظور تولید وکتور بیانی نوترکیب دا...

متن کامل

مطالعه بیوانفورماتیکی توالی‌های پروتئین آلیناز در گیاهان

آلیناز (EC 4.4.1.4) آنزیمی وابسته به پیریدوکسال فسفات است که تبدیل آلین به آلیسین را انجام می‌دهد. آلیسین ترکیبی ارگانوسولفوره با ویژگی‌های ضد‌میکروبی، ضد‌سرطانی، ضد‌دیابتی و آنتی‌اکسیدانی است. مطالعه بر روی آلیناز و درک چگونگی تنظیم تولید آلیسین برای تولید در محل آن جهت مصارف کلنیکی ضروری است. در این مطالعه، توالی‌های پروتئین آلیناز گیاهی از سایت ExPASy و NCBI دریافت‌شدند و با ClustalW همردیفی...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
پژوهش های سلولی و ملکولی

جلد ۲۸، شماره ۲، صفحات ۲۱۱-۲۲۲

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023